Ao editar um arquivo javascript no Visual Studio é possível indicar ao Intellisense quais arquivos Javascript devem ser considerados, melhorando assim o acerto e produtividade ao programar em Javascript.
A indicação de arquivo é feito através de uma linha de comentário com a tag Reference.
Por exemplo:
SEM REFERENCIA
COM REFERENCIA
Uma questão importante aqui é que este arquivo com a referência é o arquivo de desenvolvimento (debug), sendo que para produção este arquivo deve passar por um processo de minificação (ver mais). Este processo irá remover tudo que não é necessário para produção, como é o caso deste comentário com reference..